《魔幻铁路历险记》由最受孩子们欢迎的电视连续剧《火车头托马斯和他的朋友们》改编而成。该片秉承了原片无与伦比的魔法魅力，而且首次采用宽荧幕的形式向观众展示这种"半真人演绎半动画制作"的新派电影。 11岁的Lily（由Mara Wilson扮演）坐火车去她爷爷家玩。她爷爷（由Peter Fonda扮演）年轻时可是一名快乐的铁路工程师，但是现在过着孤独的生活。没想到Lily坐错了火车，最后在一个景色优美的小镇下了车。那个小镇名为" 美丽时光"， 在那里Lily遇上了一位会使魔法的列车长（由Alec Baldwin扮演），跟着他又上了火车，沿着"魔幻铁路"开始去苏达岛的探险之旅。要知道苏达岛可是一个玩具王国，可爱的Thomas（迷你型蓝色蒸气车头玩具）就住在那,但是现在这个"世外桃源"正在受到贪婪和愚昧的侵蚀。于是Lily 和Thomas联手，在小狗Mutt、小男孩Patch等其他许多好朋友们的帮助下，共同惩治坏蛋，最终使故事有了一个圆满的结尾。

哈瑞（杰瑞德·莱托 Jared Leto 饰）和玛丽安（詹妮弗·康纳利 Jennifer Connelly 饰）彼此相爱，梦想着开个服装店，梦想着有个美好的明天。然而他们都离不开毒品，并想着以销毒赚得第一桶金。哈瑞的母亲是个彻底的电视迷，最大的梦想是上电视，为此不顾年迈吞食减肥药。由于药品里的毒品成分，她渐渐上了瘾。哈瑞的朋友狄龙（马龙·韦恩斯 Marlon Wayans 饰）同样是个瘾君子，为了挣大钱加入了黑社会。为了梦想，他们努力着，却一步步深陷毒品难以自拔。 哈瑞的胳膊因注射毒品感染而被割去；玛丽安为了毒品出卖肉体和自尊；哈瑞的母亲最终住进了精神病院受尽折磨；狄龙锒铛入狱。当视线变得模糊，梦在遥远处呼唤，迷失的人该以怎样的姿态安抚自己的灵魂。©豆瓣

有一天，玛姬（金·贝辛格 Kim Basinger 饰）的妹妹珍娜（安吉拉·贝蒂斯 Angela Bettis 饰）带着她的女儿科迪（霍利斯顿·科尔曼 Holliston Coleman 饰）找到了玛姬，希望她能照顾她。然而，自那之后，珍娜再也没有任何消息。六年后，珍娜再次出现，这次她带来了新婚丈夫艾瑞克（卢夫斯·塞维尔 Rufus Sewell 饰），他是一位知名电视台主持人，同时也是一个新宗教团体的传道者。他们要求玛姬归还科迪。正当玛姬感到无助时，FBI干员约翰（吉米·斯密茨 Jimmy Smits 饰）发现了艾瑞克与最近发生的失踪和谋杀案有关。于是他决定帮助玛姬查找科迪的下落。原来，艾瑞克之所以绑架科迪，是因为他相信科迪是耶稣使徒的转世，并且从小就表现出一些超自然能力。然而，无神论者的玛姬对此并不相信。

一名被收养的妇女试图寻找她的家人，最终发现她在还是个小女孩的时候就在保留地被从她的亲生母亲身边偷走了。