唐贞观初年，一系列带有神秘色彩的案件频发，先是操作死尸的傀儡术案，接着又是古老的汉代游侠刺客组织重现，利用木人诅咒以及山鬼和天雷等一系列围绕宫廷权贵和皇室秘史的灵异事件屡现。校尉尉迟方无法破案，“娘子军”统领平阳公主之女拂云也屡被卷入案中，幸得隐居于长安的青年才俊李淳风频频相助，利用中国古典医学、术数学、方技侦破案件。而在此过程中，李淳风也与拂云惺惺相惜，萌生爱意。然而为了完成和亲沙陀共讨突厥的使命，两人终以“参商星”喻之，天各一方。
因为宫中迎来美丽多情的回族公主香妃（刘丹），乾隆（张铁林）心情大好，然而他却没本事将这种好心情传递，并非自愿入宫的香妃一心惦念的只是之前的恋人。香妃的不幸遭遇引起小燕子的极大同情，在福尔康（周杰）、紫薇（林心如）等人的帮助下，小燕子想出妙计令香妃成功逃出宫，却因 此为她和紫薇招致杀身之祸。萧剑（朱宏嘉）、柳青（陆诗雨）等人勇劫法场将小燕子与紫薇救出，与福尔康、永琪（苏有朋）等人作过会合后开始了集体大逃亡。而宫内，乾隆和皇后各怀心机，小燕子等人的命运变得扑朔迷离。
姜乐瑶惨死后，重生回到了嫁入宁府的前一夜!她的闰蜜乡野丫头蓉儿也重生了。但这一世蓉儿竟顶替了姜乐瑶的身份代替她嫁入了宁府。姜乐瑶上一世的高门生活堪称练狱，不仅被嫁给痴傻的宁府少爷，更发现烧死她父母的火灾根本不是天灾，而是人祸，凶手正是以宁府嫡女宁冰清为首的权贵子弟。
该剧主要讲述了第九医院的神经内科主任丁学坤意外身亡，远在瑞典留学的精英西医儿子丁远志与多年在外的中医学徒韩西林回到九院，共同调查死因真相的故事。在追求真相和救死扶伤的过程中，两个年轻医护工作者从最初的磨合到最终彼此放下隔阂，相互扶持，将传统中医诊疗手段和现代西医技术有机结合，解决了诸多疑难杂症。两人致力于弘扬中医药文化、推进中西医结合创新诊疗，共同历经了坚守与成长。
