《雕刻时光》讲述一项医学研究成果“RT4”的主要研究者陆炳文教授的艰难研究之路，故事围绕他的家庭、学生、医学研究徐徐展开，把新老两代人的情感纠葛淋漓尽致地展现在观众面前。画面充满诗意，人物刻画细腻真实，情节跌宕起伏，在恍若时光河流缓缓流逝的岁月中，许多东西会让你感慨万千，直击心底。正如片尾曲所唱的那样：慢慢的一切都过去了，一切都被时光雕琢着，时光磨灭满怀的忧伤，见证心灵的成长……

一个身患白血病的台湾女孩梧桐，为寻找二十多年前失散的父亲及孪生姐姐，来到了首都北京，从此开始了她横跨海峡和生死的奇妙旅程。在她到达机场的同时，一个年轻摄影师木枫刚从云南“流浪”回北京，也赶到机场想阻止女友的婚礼，但没能如愿。于是他走向机场大楼开着的飘窗前，一幅视死如归的表情。楼下的围观群众中也有梧桐，木枫身子一晃，却没有跳下来，而是扔下了一个少数民族风情的木雕挂件，刚巧落在梧桐的脚边，梧桐捡起了它，男子转眼没了踪影……梧桐从母亲那儿得知父亲当年是在云南下乡的“知青”，便突发奇想搭一个“背包客”的顺风车边走边看地去云南。而她通过酒吧布告上联系的背包客，竟然就是木枫！本来就觉得爱情没有自由重要的木枫因为女友的事更不想接触女人，不愿载女旅伴同行。谁知梧桐跟他十分有缘，在路上几次遇见，并帮他修车、做饭，两人一路打打闹闹的，却滋生出了别样的情感。等结伴到了充满艺术气息的丽江，他们已俨然一对亲密的情侣，可梧桐并没找到父亲和姐姐的消息。

米亚高公司总裁高卓文准备在新产品发布会上，宣布独子高峰（郭晋安饰）接手公司事务。峰在会前向女友兼产品代言人乐佩佩提出分手，谁知佩佩在穿上红旗袍，在台上自称林敏，疯言疯语。峰发现佩佩的话语是六十年代自杀女性林敏遗作中的对白。峰的好友警察钟智坚正调查的女子自杀案，死者死前亦自称林敏。调查中认为新助理司徒珊（伍咏薇饰）十分可疑，遂调查她的身世，发现她母亲有精神病史，亦爱扮演林敏，最后自杀而亡。
　　高卓文在家中被杀害，但家中每个人都有不在场的证据。律师宣读遗嘱时，峰竟一无所得，而最大的得益者是司徒珊。峰失去父亲又遭受家庭突变，离开香港去调查真相。司徒珊原来是高卓文的亲生女儿，峰的身世顿时扑朔迷离，他的母亲是谁？生父是谁？这个谜一样的家庭里，还埋藏着多少不为人知的秘密？