本片将描绘被称为日本史上最大谜团的“本能寺之变”前一日，追踪这一谜团的历史悬疑电影。故事从现代的京都开始，正处于即将结婚的人生岔路上的茧子（绫濑遥 饰）住进了一家本能寺酒店，这是一家能够与战国时代相连的不可思的酒店，茧子在这里遇见了即将统一天下的织田信长。

郊外一座废弃的工厂内，一支摄制组正在拍摄一部粗糙简陋的僵尸片。导演日暮隆之（滨津隆之 饰）不满女主角松本逢花（秋山ゆずき 饰）的演技，因此暴跳如雷，大吼大叫。在工作人员晴美（しゅはまはるみ 饰）的建议下，剧组暂时停止拍摄。休息间隙，晴美向松本以及饰演僵尸的男演员神谷和明（长屋和彰 饰）讲述了这座工厂在二战期间的恐怖旧事。就在此时，不祥的巨响突然传来，未过多久，一名工作人员化作僵尸突然出现，对其他剧组成员展开疯狂啃咬。演职员们四散而逃，而疯狂的导演却举起摄像机，开始了他梦寐以求的电影的拍摄。

《新宿天鹅2》的故事舞台随着同名漫画续作发展，搬到了日本横滨上演。男主角白鸟龙彦（绫野刚 饰）将与浅野忠信所饰演的“横滨巫师”社长泷正树正面对抗，在漫画中，泷正树是“新宿天鹅史上最恐怖的敌人”，这个角色，由怪咖影帝浅野忠信来演绎简直再合适不过。

该片根据2005年山口雄大与山本淳一执导的科幻恐怖片《人肉机器》改编，讲述人类与神秘生命体寄生的怪物战斗的故事。 　　催债人野田勇次是个连定额任务都无法完成、就算被上司欺负也不敢吱声的中年男人。而且他被医生告知患了癌症。就在他生无可恋之时，一个神秘的生物寄“unit”寄生在了他身上。被“unit”寄生的人，最终都会丧失人格，变成人肉机器。但是，不知为何，勇次没有完全被机器化，为了保护心灵深处存有的自我意识，他一次次与人肉机器人们展开战斗。